오키나와 북쪽에 사는 중학생 토도 아키라는, 누나인 하루카 그리고 카페를 운영하는 엄마와 셋이서 평온한 일상을 보내고 있었다. 하지만 이 가족에게는 어떤 비밀이 있었다. 하루카는 아빠로부터 '엔진'이라고 불리는 힘을 물려받았고, 다른 사람들에게는 그 힘을 숨긴 채 생활하고 있었던 것이다. 한편 아키라는 아빠의 힘을 물려받지 못했고, 자신이 약한 것에 콤플렉스를 품고 있었다. 그런 가운데 전 세계에 이변이 발생했다. 아키라네 가족에게 다가오는 정체불명의 적의 목적은... 그 상황에서 '파워 다운'이라 불리는 전 세계의 네트워크가 마비되는 현상이 일어났다. 아키라네 가족은 불편함을 느끼면서도 일상을 보냈지만, 갑자기 하루카의 이마가 빨갛게 빛났다. 그것은 한때 EDVA가 지구에 쳐들어왔을 때 아빠의 몸에 일어난 것과 동일한 현상이었는데... 우주의 명운을 짊어진 소년소녀의 싸움이 지금 시작된다.